夏洛克洞悉恐怖分子的計劃，殺死了在自身注射病毒的犯人，成功阻止了病毒的擴散。但是，警方仍把夏洛克當成嫌疑人進行搜索，力挺她的禮紋警部被排除在搜查本部以外，被夏洛克奪走手槍的柴田巡查部長提出辭職，離開了警界。在波多野和健人的協助下，夏洛克追蹤著一切恐怖計劃的幕后主使者，試圖阻止對方的下一步計劃并奪回落入“森脅彰”手中的和都。擁有卓越洞察力和推理力的夏洛克與她最大敵人之間的決戰開始了。