從1932年開始，一個叫石井四郎的日本人對中國人實施病毒戰，建立臭名昭著的七三一生化部隊，研究出許多致人慢性中毒的細菌。

這些細菌被日本人投放到上海各處水井內，上海市民們渾然不知，照常取水回家食用。阿寶到一口水井打了一桶水，返回住處，口干舌燥喝了幾口打回來的井水。

中國面臨著被日本人細菌侵害的危險，愛國醫學博士葉振元攜女葉莎莎奔赴上海，帶了一箱抗生素資料，打算送給醫術精湛的唐余錦，讓唐余錦根據資料研發出抵抗細菌的藥物。

日軍特務部門第一狙擊手崗倉在列車上等侯多時，侍機奪取葉振元手中的資料。與此同時，復興社姚站長派出劉子剛在內的幾個下屬踏上列車，眾人的目標也是抗生素資料。

崗倉身手不凡，制奇混亂奪走了葉振元手中的箱子，將假箱扔在地上，葉振元拾起假箱子，以為資料還在，下車與地下黨員丁偉漢會面。

東山將崗倉領到日本料理館進食，崗倉與黑羿有不共戴天的仇恨，此番來上海，一為替父報仇殺掉黑羿，二為東山執行任務。

唐余錦得到葉振元贈送的抗生素資料，返回住處，阿寶因為喝了含有細菌的井水，不時咳嗽，漸而咳出了大量的血液。

劉子剛未能奪到抗生素資料，返回姚站長身邊復命，姚站長氣急敗壞訓了劉子剛一頓。

崗倉為了不打草驚蛇，晚上來到葉振元的住處，放下裝有抗生素資料的箱子，制造聲音悄悄離去。劉子妍聽到門外有聲音，開門發現地上放著一個黑箱子，里面放著抗生素資料，葉振元曾把黑箱子交給唐余錦，黑箱子忽然被人送回來，葉振元以為送箱子的是唐余錦，漸而認為唐余錦不愿意研發抗生素。

深夜，唐余錦坐在辦公室認真研究資料，阿寶的病情迅速加重，躺在房間里面劇烈咳嗽，唐余錦察覺到阿寶身體出了大問題，離開辦公室往阿寶睡覺的房間跑去。