另一方面，正當(dāng)守城官兵屈于邊關(guān)兵馬的威勢(shì)而不得不開城門之時(shí)，瑪爾賽突然倒戈背叛了鰲拜，將邊關(guān)將領(lǐng)刺死，同時(shí)索額圖帶兵攻入紫禁城，與納爾杜等人展開激戰(zhàn)。此舉令鰲拜也是大感意外，但事已至此無法回頭的鰲拜不得不背水一戰(zhàn)，意欲擒下玄燁，由此與玄燁曹寅及眾布庫(kù)展開了殊死一戰(zhàn)。危急時(shí)刻，一旁的遏必隆使出致命一擊，毫無防備的鰲拜頓時(shí)敗于下風(fēng)，不得不束手就擒。玄燁終于完全制服了鰲拜，至此，才開始了真正親政的日子，手中牢牢掌握住了大權(quán)。總攬大權(quán)后的玄燁勵(lì)精圖志，制定了不少政策措施，同時(shí)還為明史案，天算案，圈地案及蘇克薩哈平反。在乾清宮中，玄燁更是將河務(wù)、漕運(yùn)、三藩視為三件頭等重要的大事，寫于柱子之上。聚忠作為玄燁的軍師兼好友也是盡心盡力輔佐玄燁。此時(shí)，三藩之一的平南王尚可喜上奏請(qǐng)求撤藩，引起聚忠的忌慮，玄燁對(duì)此避而不談。事實(shí)上，玄燁一直與安親王秘密商議撤藩之事。玄燁在第二日早朝之時(shí)宣布答應(yīng)尚可喜的撤藩請(qǐng)求，令朝中大臣們議論紛紛。此時(shí)得知消息的吳三桂和耿精忠也上奏請(qǐng)求撤藩。擒鰲拜事之后的遏必隆被貶官，落魄之時(shí)受到玄燁的格外關(guān)切，還與皇帝賭了起來，但卻意外地于當(dāng)夜猝死。