會津公下了命令要除掉芹澤，歲三近藤決定合眾人之力殺掉芹澤，龍之介得知此事，竟已來不及告訴大家芹澤的身體問題，最終芹澤被殺，眾人亦決意殺死跑丟的龍之介，然而被總司找到的龍之介展示出與其最早截然不同的求生欲，最終被總司推進河里故意放跑。從此新選組在黑暗之后走入了黎明，而變若水的研究轉而由山南進行。